Jak działa BLAST?

BLAST dokonuje „lokalnego” uporządkowania. Większośd złożonych białek występujących w naturze ma złożony charakter, funkcjonalne domeny są często powtarzane w tym samym białku, jak również wśród białek pochodzących od różnych gatunków. Algorytm BLAST pozwala znaleźd te domeny lub krótsze odcinki podobieostwa sekwencji.